Геномика и геномный анализ

На обучение по программе дополнительной образовательной программы приглашаются студенты имеющие базовые знания в области генетики, соответствующие уровню бакалавриата и специализации в области генетики (владение материалом курсов «Генетика», «Молекулярная генетика», «Генетическая инженерия», «Биоинформатика»), владение английским языком на уровне понимания текста научной публикации.

Форма организации отбора участников

Мотивационное письмо (оценивается от 0 до 20 баллов) должно включать ответы на вопросы: почему участнику важно попасть именно на этот образовательный модуль, какие знания и компетенции он планирует развить в результате прохождения обучения.

Резюме (оценивается от 0 до 10 баллов) включает:
- перечень основных курсов в области генетики, прослушанных ранее, и результаты промежуточной аттестации по данным курсам;
- описание опыта работы в научных лабораториях (стаж, функционал, полученные компетенции);
- перечень научных публикаций (до 5);
- перечень научных конференций и школ, в которых студент принимал участие (до 10);
- уровень владения английским языком.

Задание (онлайн-тестирование, оценивается от 0 до 20 баллов)

Включает вопросы по общей и молекулярной генетике, по генетической инженерии и биоинформатике (10 тестовых заданий (1 балл за каждое) и одно задание, требующее развернутого ответа (10 баллов).

Пример тестового задания (1 балл):
К мобильным элементам эукариот относятся
А. Инсерционные элементы, ДНК-транспозоны и ретротранспозоны
Б. Инсерционные элементы и ДНК-транспозоны
В. ДНК-транспозоны и ретротранспозоны
Г. Инсерционные элементы и ретротранспозоны

Пример вопроса, требующего развернутого ответа (10 баллов):
Составьте схему типичного эксперимента по клонированию гена человека в клетках бактерий. Какие проблемы при могут возникнуть в ходе такого эксперимента?

Также мы просим участников отбора предоставить нам следующие документы, указанные ниже.

Справку с места обучения;

Сертификаты пройденных курсов/программ (при наличии);

Научные публикации, относящиеся к тематике образовательного модуля (при наличии).

Программа знакомит слушателей с современными методами анализа генома и их приложениями. В ходе лекций и семинаров будут рассмотрены теоретические и прикладные аспекты геномики и молекулярной цитогенетики, экспериментальные и биоинформатические подходы для анализа и интерпретации геномных и эпигеномных данных, симбиогеномика и протеомика. Теория будет сопровождаться практическими занятиями – практикумом по освоению методов секвенирования геномов, включая методы пробоподготовки, и методов обработки данных секвенирования. Будут освещены новейшие достижения и направления по исследования организации генома и эпигенетической регуляции генов в норме и патологиях. Особое внимание будет уделено методам биоинформатического анализа больших геномных данных, интерпретации данных секвенирования индивидуальных геномов для персонализированной медицины. Будут рассмотрены основные подходы, используемые при обработке генетических и геномных данных, возникающие проблемы и возможные подходы к их решению. Будут также рассмотрены подходы к предсказанию потенциальных фармакологических мишеней на основе анализа геномных и протеомных данных. На примерах анализа геномов и протеомов будет рассматриваться решения проблем фундаментальных процессов макро- и микроэволюционных процессов.

Цель:
- освоение теоретического материала и инновационных экспериментальных методов в области геномики и эпигеномики

Задачи:
- Познакомить слушателей с возможностями системной биологии в анализе результатов геномных исследований
- Сформировать представление о методах и достижениях современной эпигеномики
- Познакомить с методами протеомики
- Дать представления о single-cell-геномике
- Сформировать представление о геномике и протеомике симбиотических систем
- Ознакомление с методологиями геномного секвенирования

МГУ имени М.В. Ломоносова
Рогаев Евгений Иванович - д.б.н., заведующей кафедрой генетики биологического факультета
Прохорчук Егор Борисович – д.б.н., профессор кафедры биотехнологии биологического факультета
Нефедова Лидия Николаевна – д.б.н., доцент кафедры генетики биологического факультета
Климов Евгений Александрович – д.б.н., ведущий научный сотрудник кафедры генетики биологического факультета
Дмитриев Сергей Евгеньевич – к.б.н., доцент факультета биоинженерии и биоинформатики

Санкт-Петербургский государственный университет
Чернов Юрий Олегович – профессор, руководитель Лаборатории биологии амилоидов, профессор Технического института Джорджии, Атланта, США
Фролов Андрей Александрович – к.б.н., доцент, каф. биохимии
Билова Татьяна Евгеньевна – к.б.н., ассистент, каф. физиологии и биохимии растений

Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского
Тарабыкин Виктор Степанович – д.б.н., профессор, заведующий лабораторией, НИИ Нейронаук

Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики (Университет ИТМО)
Беатович Александар – магистрант, биоинформатика и системная биология
Григорьева Елизавета Александровна – магистрант, биоинформатика и системная биология

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (ИОГен), Москва
Тяжелова Татьяна Владимировна – к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории эволюционной геномики ИОГен РАН
Манахов Андрей Дмитриевич – младший научный сотрудник лаборатории эволюционной геномики ИОГен

НИИ Физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ
Дмитриев Сергей Евгеньевич – к.б.н., старший научный сотрудник
Кулаковский Иван Владимирович – к.ф.-м.н., старший научный сотрудник

Институт Цитологии и Генетики СО РАН, Новосибирск
Фишман Вениамин Семенович – к.б.н., зав. сектором геномных механизмов онтогенеза ИЦиГ СО РАН

ФГБУ "НМИЦ кардиологии" Минздрава России, Москва НИЛ "Медицинская геномика" ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва
Киселев Иван – к.б.н., научный сотрудник лаборатории функциональной геномики сердечно-сосудистых заболеваний
Баулина Наталья – к.б.н., научный сотрудник лаборатории функциональной геномики сердечно-сосудистых заболеваний

Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН, Москва
Прохорчук Егор Борисович - д.б.н., заведующий лабораторией

Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург
Жуков Владимир Александрович - к.б.н., заведующий лабораторией генетики растительно-микробных взаимодействий
Зорин Евгений Андреевич – аспирант

QIAGEN
Апчелимов Алексей Андреевич, к.б.н., директор представительства QIAGEN в России

Всем, кто прошел конкурсный отбор и был приглашен на программу, необходимо получить и отправить на почту oumr.university@talantiuspeh.ru скан-копии:

1) справки о санитарно-эпидемиологическом окружении, полученной не ранее чем за 3 дня до выезда в Университет;

2) справки с отрицательным результатом тестирования методом ПЦР на новую коронавирусную инфекцию COVID-19, полученной не ранее чем за 3 дня до выезда в Университет.

По приезде в Университет участникам образовательного модуля следует предоставить оригиналы указанных документов (справки и результата теста) во время регистрации участников.

Научно-технологический университет «Сириус» обеспечивает проживание, проезд / перелет по территории РФ и питание для участников программы.

Плата за обучение на программе не взимается.

К участию в программе допускаются только граждане РФ.

Образовательные организации высшего образования:

Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова
Санкт-Петербургский государственный университет
Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского
Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики (Университет ИТМО)

Научные организации:

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (ИОГен), Москва
НИИ Физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ
Институт Цитологии и Генетики СО РАН, Новосибирск
ФГБУ «НМИЦ кардиологии» Минздрава России, Москва
НИЛ «Медицинская геномика» ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва
Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН, Москва
Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург

Технологические партнеры:

QIAGEN

Образовательный Фонд "Талант и успех"