Принципы анализа и моделирования молекулярных ансамблей в свете дизайна фармакологически активных агентов

Программа направлена на формирование у обучающихся базового набора компетенций, необходимых для осуществления профессиональной деятельности в области компьютерного молекулярного дизайна, в том числе: компьютерная разработка лекарств, методы обработки больших массивов химических данных, прогнозирование химико-физических и биологических свойств молекул. В программе представлены как классические, так и современные задачи, модели и методы компьютерного молекулярного моделирования и дизайна.

Соответствующие компетенции включают широкие области хемоинформатики, квантовой химии, биоорганической химии, методы QSAR, лиганд-ориентированного и структурно-ориентированного молекулярного дизайна, методы работы с моделями белков, как основных мишеней для таргетной терапии социально значимых заболеваний.

Выпускники данной программы будут иметь квалификационный потенциал для работы в R&D структурах фармацевтических компаний, , IT-компаниях, занимающихся разработкой решений для химии и фармакологии, в НИИ и университетах, где ведутся исследования в области разработки новых биологически активных молекул, а также в иных профессиональных областях, связанных с компьютерным молекулярным моделированием и применением IT в химии и драгдизайне.

Цель:

Совершенствование компетенции методов современного компьютерного молекулярного конструирования как междисциплинарной научной области, находящейся на стыке химии, физики, математики и программирования, анализа больших данных, биологии и фармакологии, необходимой для профессиональной деятельности

Задачи:

• познакомить слушателей с основами биологической, медицинской и математической химии;
• познакомить слушателей с основами компьютерного молекулярного конструирования;
• познакомить слушателей с основными математическими подходами к предсказанию физических, химических и биологических свойств веществ;
• познакомить слушателей с основами органической химии, научить решать задачи, связанные с получением, хранением и предсказанием структуры органических веществ, обладающих заданными физико-химическими характеристиками;
• познакомить слушателей с основными структурами белков и их моделированием.

На обучение по программе приглашаются студенты, обучающиеся по программам бакалавриата или специалитета, закончившие на момент начала программы как минимум 1 курс, а также студенты магистратуры (вне зависимости от курса) или аспиранты 1-го года обучения, обучающиеся по направлениям подготовки: математика и механика (01.00.00), компьютерные и информационные науки (02.00.00), информатика и вычислительная техника (09.00.00), химия (04.00.00), фармация (33.00.00), биоинженерия и биоинформатика (06.05.01), а также обучающиеся по другим направлениям подготовки, при условии наличия у кандидатов достаточного уровня знаний и компетенций в области фундаментальной и прикладной математики, компьютерных наук и программной инженерии.

Для освоения содержания дополнительной профессиональной программы слушатели должны владеть следующими знаниями и компетенциями:

• знания в области химии: биологическая, органическая или медицинская химия;

• основы структурной биоинформатики, строение белков и малых органических молекул;

• основы программирования (языки C++ или Python, основы Unix, алгоритмы и структуры данных);

• желательно наличие знаний в области высшей математики (матанализ/линейная алгебра/теория вероятностей/основы матстатистики);

• знание английского языка, достаточное для чтения учебной литературы и документации. Несмотря на то, что настоящая программа преподается на русском языке, большинство рекомендуемой учебной литературы, составляющей неотъемлемую часть программы, представлено на английском языке.

Форма организации отбора слушателей:

Индивидуальный отбор.

Задания для проведения отбора слушателей не предусмотрены

Критерии отбора слушателей

Основным критерием отбора являются итоговые академические оценки кандидатов по перечисленным предметам, соответствующим знаниям и компетенциям, во взаимосвязи с рейтинговыми позициями учреждений высшего образования, в которых эти оценки были получены. Конкурсная комиссия оставляет за собой право интерпретации критериев отбора слушателей.

• Резюме (до 20 баллов)

Резюме должно содержать следующую информацию:

- ФИО, дата рождения, место учебы (вуз, факультет, курс);

- направление подготовки, тематика дипломной или научно-квалификационной работы;

- опыт участия в исследовательских проектах (гранты, проекты, договорные работы, экспедиции и проч.);

- перечень научных публикаций;

- перечень научных конференций и школ, интенсивов или тренингов, в которых студент принимал участие;

- награды и поощрения;

- научные интересы;

- уровень владения английским языком.

- академические оценки кандидатов по предметам, соответствующим знаниям и компетенциям во взаимосвязи с рейтинговыми позициями учреждений высшего образования, в которых эти оценки были получены: 01.00.00 (математика и механика), 02.00.00 (компьютерные и информационные науки), 09.00.00 (информатика и вычислительная техника), 04.00.00 (химия), 33.00.00 (фармация), 06.05.01 (биоинженерия и биоинформатика).

• Сертификаты пройденных курсов/программ по теме программы (до 20 баллов);

​

• Участие в тематических научных конференциях (сертификат, тезисы доклада) (до 20 баллов);

​

• Научные публикации, относящиеся к тематике образовательного модуля (зачётными считаются статьи в журналах ВАК и Scopus) (до 20 баллов);

​

• Экспертная оценка мотивационного письма (до 20 баллов).

​

Каждый пункт оценивается по двадцатибалльной шкале. Максимальное количество баллов – 100.

Суммарные значения результатов отображаются в итоговом рейтинге участников. 20 участников, продемонстрировавших наилучшие результаты и выполнивших общие (технические) требования к заявке, приглашаются на обучение по программе. Спорные вопросы решаются на уровне руководителя программы.

Порозов Юрий Борисович, руководитель лаборатории, к.м.н., доцент, АНО ВО «Университет «Сириус», руководитель Центра био- и хемоинформатики ПМГМУ им. И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Борисевич София Станиславовна, к.х.н., с.н.с. Центра компетенций НТИ при Институте проблем химической физики РАН, г. Черноголовка, с.н.с. лаборатории химической физики Уфимского института химии УФИЦ РАН г. Уфа

Гуреев Максим Александрович, к.х.н., научный сотрудник группы биоинформатики АНО ВО «Университет «Сириус», научный сотрудник Центра био- и хемоинформатики Сеченовского университета

Миндич Алексей Леонидович, руководитель ресурсного центра химического синтеза, к.х.н., АНО ВО «Университет «Сириус»

Якухнов Сергей Андреевич, специалист ресурсного центра химического синтеза, к.х.н., АНО ВО «Университет «Сириус»

Ильина Маргарита Григорьевна, к.х.н., н.с. Российско-американского противоракового центра Алтайского государственного университета, м.н.с. лаборатории химической кинетики Уфимского института химии УФИЦ РАН

Соловьёв Ярослав Владимирович, аспирант ИБХ РАН

Куляев Павел Олегович, м.н.с. АНО ВО «Университет «Сириус»

Образовательные организации высшего образования:

Санкт-Петербургский государственный университет

Научные организации:

Институт проблем химической физики РАН, г. Черноголовка

Уфимский институт химии УФИЦ РАН г. Уфа

Технологические партнеры:

Научно-технологический парк биомедицины первого Московского государственного медицинского университета имени И. М. Сеченова

Всем, кто прошел конкурсный отбор и был приглашен на программу, необходимо привезти с собой один из следующих документов:

- сертификат о вакцинации (достаточно первого компонента вакцины) или справку о прохождении первого этапа вакцинации (на бумажном носителе);
- медицинский документ или сертификат о перенесенном заболевании из личного кабинета портала Госуслуг, со дня выздоровления не более 6 месяцев до заселения (на бумажном носителе);
- отрицательный результат ПЦР-теста (полученный не ранее, чем за три календарных дня до заселения) и обязательно добровольное согласие на прохождение вакцинации в течение трех дней со дня вселения. Обратиться в прививочный пункт необходимо самостоятельно.

А также справку с места обучения, полученную не ранее, чем за 3 месяца до начала программы.

По приезде в Университет участникам образовательного модуля следует предоставить оригиналы указанных документов во время регистрации участников.

АНО ВО «Университет «Сириус» обеспечивает проживание, проезд / перелет по территории РФ и питание для участников программы.

Плата за обучение на программе не взимается.

К участию в программе допускаются только граждане РФ.