На программе «Большие вызовы» в Сириусе школьники с помощью методов биоинформатики смоделировали новую молекулу, которая блокирует активный центр тирозинкиназа Брутона – фермент, участвующий в созревании и работе клеток иммунитета. Блокировка этого фермента потенциально может замедлить развитие аутоиммунных заболеваний. Проектом руководят специалисты биотехнологической компании BIOCAD, которая является резидентом Инновационного научно-технологического центра Сириус.
«Тирозинкиназа Брутона играет важную роль в образовании B-лимфоцитов – клеток, отвечающих за приобретенный иммунитет. Переизбыток или недостаток таких клеток вызывает аутоиммунные и аллергические заболевания. Мы занимаемся частным случаем – когда таких клеток в избытке, стараемся выключить тирозинкиназу Брутона, чтобы больной чувствовал себя лучше», – рассказал участник проекта Антон Юдин из Сыктывкара.
По словам юных ученых, на фармацевтическом рынке уже существуют подобные препараты, блокирующие тирозинкиназу, но при их использовании у пациентов появляются серьезные побочные эффекты, например, внутреннее кровоизлияние.
«Наша цель – подобрать такую молекулу, чтобы получилось лекарство с минимальными побочными эффектами», – подчеркнул участник.
Работа над проектом включала три этапа. В первую неделю участники выбирали молекулу X с помощью биоинформатических методов – ребята учились применять современные методы компьютерного моделирования для генерации библиотек соединений-кандидатов, потенциально отвечающих требуемой биологической активности.
Второй этап работы – это получение вещества в лаборатории органического синтеза. Третью неделю посвятили испытаниям активной молекулы на клеточных культурах.
«Здесь мы показываем ребятам, чем занимается “big фарма”. Проект полностью воссоздает процесс получения новой молекулы: от расчетов до синтеза вещества и клеточных тестов. Ребята задействованы на всех стадиях», – рассказал руководитель проекта Илья Сметанин – химик-синтетик 1-й категории BIOCAD.
24 июля школьники продемонстрируют результаты расчетов и экспериментов на итоговом фестивале проектов в Сириусе.