Программа организуется Образовательным Фондом «Талант и успех» и компанией «Биокад», ориентирована на студентов, хорошо знакомых с основными понятиями и методами молекулярной биологии и следящих за мировыми тенденциями в персонализированной медицине. Участникам программы будет предложено реализовать определенные этапы R&D-проектов компании, связанные с синтезом генетических конструкций. Программа состоит из двух этапов: заочного теоретического (6 дней) и очного практического (16 дней). Теоретический этап состоит из краткого курса вводных онлайн-лекций от сотрудников компании. Практический этап будет проходить на базе Лаборатории генно-инженерных технологий Парка науки и искусств «Сириус» (Сочи).
По вопросам участия в программе обращайтесь в Центр поддержки выпускников и сопровождения грантовых программ: gid@talantiuspeh.ru
Программа реализуется в партнерстве с ЗАО «Биокад»
Направление программы: Наука / Генетика и науки о жизни (Генная инженерия, молекулярная биология)
Формат программы: Профильная, проектная, практика.
Объем программы: 168 часов, из них
• 48 часов заочно (теоретическая подготовка);
• 120 часов очно (практическая подготовка, работа над проектом)
Сроки реализации: 22 дня, 9 апреля – 30 апреля 2019 года:
• 9 апреля – 14 апреля заочно (теоретическая подготовка);
• 15 апреля – 30 апреля очно (практическая подготовка, работа над проектом)
Цели и задачи программы
• выполнение реального кейса компании
• оптимизация стандартных процедур под конкретную научную задачу в условиях лаборатории
• составление отчета о выполненной работе, отражение реального состояния проекта с учетом возникших трудностей
Планируемые результаты: В процессе освоения программы планируется, что каждый ее участник:
• получит глубокое представление о роли вычислительной биологии в персонализированной медицине\
• на практике применит знания, полученные им ранее в ВУЗе и от сотрудников компании, для реализации проекта
• освоит навыки планирования эксперимента с точки зрения постановки соответствующего контроля и организации рабочего времени
Содержательная характеристика программы
В рамках программы планируется реализация части проекта компании, посвященного кодон-оптимизации/ гуманизации генетической последовательности, кодирующей молекулу-кандидата в одном из проектов компании по получению моноклональных антител как терапевтических агентов в лечении онкологических заболеваний. Сначала участники осуществят in silico оптимизацию и гуманизацию генетических последовательностей, освоят принципы максимально эффективного дизайна олигонуклеотидов для последующего синтеза гена интереса. Затем будет поставлен параллельный синтез олигонуклеотидов с последующей очисткой и характеризацией полученных молекул. После этого из синтезированных олигонуклеотидов каждый участник проекта будет осуществлять параллельно 2-3 сборки различных вариантов гена. Полученные конструкции будут направлены в дальнейшую разработку в R&D-центры компании.
Параллельно практической работе будут проходить семинары в формате Journal club, где будут обсуждаться публикации, подходящие по тематике проекта.
Формы организации образовательного процесса
• Лекции (дистанционные и очные)
• Биоинформатический воркшоп
• Journal club
• Семинар по проекту / обсуждение текущего состояния
• Работа в лаборатории
• Круглый стол
Дистанционная составляющая программы: Первые 6 дней проекта будут дистанционными. Участникам будет предложено прослушать краткий курс вводных лекций от сотрудников компании, а также самостоятельно изучить предложенные статьи и материалы, которые будут им предоставлены в начале проекта.
Вариативная часть программы: Если участникам будет не хватать знаний в какой-либо области даже после подготовительной теоретической недели, научный руководитель обеспечит необходимые материалы в электронном виде, а также организует лекцию, если будет такая возможность. Пример: Лекция по этике в науке, дизайн эксперимента, построение кросс-функциональных команд.
Требования к условиям организации образовательного процесса: Программа будет полностью осуществляться на базе Лаборатории генно-инженерных технологий.
Этап работы / Необходимые ресурсы
• Дизайн олигонуклеотидов / Учебная аудитория с проектором для демонстрации экрана компьютера преподавателя, компьютеры по числу участников с доступом в интернет
• Синтез олигонуклеотидов, Постсинтетическая обработка, 1,2,3 этапы сборки / Лаборатория генно-инженерных технологий
• Подготовка к презентации, презентация / Учебная аудитория с проектором, компьютеры по числу участников с доступом в интернет
Оценка реализации программы и образовательные результаты программы
Содержательный модуль / Оценка в баллах
• Активность на семинарах по проекту / 0 – 10
• Выступление на Journal club / 0 – 20
• Самостоятельность в работе над проектом / 0 – 40
• Участие в подготовке презентации, презентация / 0 – 30
Итого / 100
Кадровое обеспечение: Лекции будут читать сотрудники компании, научное руководство будет осуществляться также сотрудниками компании, экспертную оценку на защите проектов будут осуществлять сотрудники компании, а также приглашенные эксперты. Экспертную поддержку всего проекта будет оказывать Научный директор компании BIOCAD.
Дидактические материалы к программе: Материалы для дистанционного этапа будут предоставлены участникам непосредственно перед началом проекта. Далее материалы будут выдаваться по мере прохождения определенных этапов проекта.
Электронные ресурсы программы
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
http://ugene.net/
http://www.snapgene.com/
http://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/
По итогам регистрации на программу было подано 95 заявок.
По итогам рассмотрения заявок отобрано 5 участников программы.
Для участия в конкурсном отборе необходимо было пройти регистрацию на сайте Образовательного центра «Сириус» в срок с 8 февраля по 5 марта 2019 года. К электронной заявке прикрепите: резюме, мотивационное письмо и решение тестовых заданий.
Требования к участникам программы:
Программа рассчитана на студентов бакалавриата / специалитета выпускных курсов, студентов магистратуры, обучающихся по направлениям биология, молекулярная биология, генная инженерия, биотехнология, биохимия, биоинформатика и другим смежным направлениям.
Обязательное требование к участникам – владение английским языком на уровне чтения научной литературы.
Отбор будет проходить на основании резюме, мотивационного письма и результатов прохождения отборочного теста.
Целевое число участников программы: 5 человек.
Результаты отбора будут опубликованы на данном сайте не позднее 18 марта 2019 г.
Руководитель лаборатории химического синтеза биополимеров ЗАО «Биокад»
Младший научный сотрудник лаборатории инженерии и скрининга антител и лаборатории генно-инженерных технологий ЗАО «Биокад»
Заместитель руководителя департамента вычислительной биологии ЗАО «Биокад»
Директор по науке департамента биоинженерии ЗАО «Биокад»
Научный сотрудник лаборатории экспериментальной валидации мишеней компании «Биокад»
Вице-президент по ранней разработке и исследованиям АО «Биокад»
Приложение 1 к программе: Отборочное задание (тест)
Приложение 2 к программе: Учебно-тематический план
Приложение 3 к программе: Пример разбиения проекта на задачи
Хранение материалов программы и система обмена знаниями: Видео с онлайн-лекциями, презентации с лекций, которые были прочитаны очно. Тексты статей, обсуждаемых на JC.
