help@sochisirius.ru
9-30 апреля 2019

Образовательная проектная программа от компании Биокад «Ген из пробирки: на стыке математики, биологии и химии»

Программа организуется Образовательным Фондом «Талант и успех» и компанией «Биокад», ориентирована на студентов, хорошо знакомых с основными понятиями и методами молекулярной биологии и следящих за мировыми тенденциями в персонализированной медицине. Участникам программы будет предложено реализовать определенные этапы R&D-проектов компании, связанные с синтезом генетических конструкций. Программа состоит из двух этапов: заочного теоретического (6 дней) и очного практического (16 дней). Теоретический этап состоит из краткого курса вводных онлайн-лекций от сотрудников компании. Практический этап будет проходить на базе Лаборатории генно-инженерных технологий Парка науки и искусств «Сириус» (Сочи).

По вопросам участия в программе обращайтесь в Центр поддержки выпускников и сопровождения грантовых программ: gid@talantiuspeh.ru

О программе

Программа реализуется в партнерстве с ЗАО «Биокад»

Направление программы: Наука / Генетика и науки о жизни (Генная инженерия, молекулярная биология)

Формат программы: Профильная, проектная, практика.

Объем программы: 168 часов, из них
• 48 часов заочно (теоретическая подготовка); 
• 120 часов очно (практическая подготовка, работа над проектом)

Сроки реализации: 22 дня, 9 апреля – 30 апреля 2019 года:
• 9 апреля – 14 апреля заочно (теоретическая подготовка); 
• 15 апреля – 30 апреля очно (практическая подготовка, работа над проектом)

Цели и задачи программы

• выполнение реального кейса компании
• оптимизация стандартных процедур под конкретную научную задачу в условиях лаборатории
• составление отчета о выполненной работе, отражение реального состояния проекта с учетом возникших трудностей

Планируемые результаты: В процессе освоения программы планируется, что каждый ее участник:

• получит глубокое представление о роли вычислительной биологии в персонализированной медицине\
• на практике применит знания, полученные им ранее в ВУЗе и от сотрудников компании, для реализации проекта
• освоит навыки планирования эксперимента с точки зрения постановки соответствующего контроля и организации рабочего времени

Содержательная характеристика программы

В рамках программы планируется реализация части проекта компании, посвященного кодон-оптимизации/ гуманизации генетической последовательности, кодирующей молекулу-кандидата в одном из проектов компании по получению моноклональных антител как терапевтических агентов в лечении онкологических заболеваний. Сначала участники осуществят in silico оптимизацию и гуманизацию генетических последовательностей, освоят принципы максимально эффективного дизайна олигонуклеотидов для последующего синтеза гена интереса. Затем будет поставлен параллельный синтез олигонуклеотидов с последующей очисткой и характеризацией полученных молекул. После этого из синтезированных олигонуклеотидов каждый участник проекта будет осуществлять параллельно 2-3 сборки различных вариантов гена. Полученные конструкции будут направлены в дальнейшую разработку в R&D-центры компании.
Параллельно практической работе будут проходить семинары в формате Journal club, где будут обсуждаться публикации, подходящие по тематике проекта.

Формы организации образовательного процесса

• Лекции (дистанционные и очные)
• Биоинформатический воркшоп
• Journal club
• Семинар по проекту / обсуждение текущего состояния
• Работа в лаборатории
• Круглый стол

Дистанционная составляющая программы: Первые 6 дней проекта будут дистанционными. Участникам будет предложено прослушать краткий курс вводных лекций от сотрудников компании, а также самостоятельно изучить предложенные статьи и материалы, которые будут им предоставлены в начале проекта.

Вариативная часть программы: Если участникам будет не хватать знаний в какой-либо области даже после подготовительной теоретической недели, научный руководитель обеспечит необходимые материалы в электронном виде, а также организует лекцию, если будет такая возможность. Пример: Лекция по этике в науке, дизайн эксперимента, построение кросс-функциональных команд.

Требования к условиям организации образовательного процесса: Программа будет полностью осуществляться на базе Лаборатории генно-инженерных технологий.

Этап работы / Необходимые ресурсы

• Дизайн олигонуклеотидов / Учебная аудитория с проектором для демонстрации экрана компьютера преподавателя, компьютеры по числу участников с доступом в интернет
• Синтез олигонуклеотидов, Постсинтетическая обработка, 1,2,3 этапы сборки / Лаборатория генно-инженерных технологий
• Подготовка к презентации, презентация / Учебная аудитория с проектором, компьютеры по числу участников с доступом в интернет

Оценка реализации программы и образовательные результаты программы

Содержательный модуль / Оценка в баллах

• Активность на семинарах по проекту / 0 – 10
• Выступление на Journal club / 0 – 20
• Самостоятельность в работе над проектом / 0 – 40
• Участие в подготовке презентации, презентация / 0 – 30
Итого / 100

Кадровое обеспечение: Лекции будут читать сотрудники компании, научное руководство будет осуществляться также сотрудниками компании, экспертную оценку на защите проектов будут осуществлять сотрудники компании, а также приглашенные эксперты. Экспертную поддержку всего проекта будет оказывать Научный директор компании BIOCAD.

Дидактические материалы к программе: Материалы для дистанционного этапа будут предоставлены участникам непосредственно перед началом проекта. Далее материалы будут выдаваться по мере прохождения определенных этапов проекта.

Электронные ресурсы программы

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
http://ugene.net/
http://www.snapgene.com/
http://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/

Участники и порядок отбора

По итогам регистрации на программу было подано 95 заявок.
По итогам рассмотрения заявок отобрано 5 участников программы.

Для участия в конкурсном отборе необходимо было пройти регистрацию на сайте Образовательного центра «Сириус» в срок с 8 февраля по 5 марта 2019 года. К электронной заявке прикрепите: резюме, мотивационное письмо и решение тестовых заданий.

 

Требования к участникам программы:

Программа рассчитана на студентов бакалавриата / специалитета выпускных курсов, студентов магистратуры, обучающихся по направлениям биология, молекулярная биология, генная инженерия, биотехнология, биохимия, биоинформатика и другим смежным направлениям.

Обязательное требование к участникам – владение английским языком на уровне чтения научной литературы.

Отбор будет проходить на основании резюме, мотивационного письма и результатов прохождения отборочного теста.

Целевое число участников программы: 5 человек.

Результаты отбора будут опубликованы на данном сайте не позднее 18 марта 2019 г.

Руководитель программы

Свечников
Иван Андреевич

Руководитель лаборатории химического синтеза биополимеров ЗАО «Биокад»

Авторы программы

Кошкарева
Кира Александровна

Младший научный сотрудник лаборатории инженерии и скрининга антител и лаборатории генно-инженерных технологий ЗАО «Биокад»

Надолинский
Александр Анатольевич

Заместитель руководителя департамента вычислительной биологии ЗАО «Биокад»

Улитин
Андрей Борисович

Директор по науке департамента биоинженерии ЗАО «Биокад»

Шеуджен
Тимур Мугдинович

Младший научный сотрудник лаборатории химического синтеза биополимеров и лаборатории генно-инженерных технологий ЗАО «Биокад»

Яковлев
Павел Андреевич

Директор департамента вычислительной биологии ЗАО «Биокад»

Материалы программы

Программа

Приложение 1 к программе: Отборочное задание (тест)

Приложение 2 к программе: Учебно-тематический план

Приложение 3 к программе: Пример разбиения проекта на задачи

Хранение материалов программы и система обмена знаниями: Видео с онлайн-лекциями, презентации с лекций, которые были прочитаны очно. Тексты статей, обсуждаемых на JC.

Подать заявку
© 2015–2021 Фонд «Талант и успех»
Нашли ошибку на сайте? Нажмите Ctrl(Cmd) + Enter. Спасибо!