help@sochisirius.ru
9-30 апреля 2019

Образовательная проектная программа от компании Биокад «Ген из пробирки: на стыке математики, биологии и химии»

Программа организуется Образовательным Фондом «Талант и успех» и компанией Биокад, ориентирована на студентов, хорошо знакомых с основными понятиями и методами молекулярной биологии и следящих за мировыми тенденциями в персонализированной медицине. Участникам программы будет предложено реализовать определенные этапы R&D-проектов компании, связанные с синтезом генетических конструкций. Программа состоит из двух этапов: заочного теоретического (6 дней) и очного практического (16 дней). Теоретический этап состоит из краткого курса вводных онлайн-лекций от сотрудников компании. Практический этап будет проходить на базе Лаборатории генно-инженерных технологий Парка науки и искусств «Сириус» (Сочи).

Участники и порядок отбора

Требования к участникам программы:

Программа рассчитана на студентов бакалавриата / специалитета выпускных курсов, студентов магистратуры, обучающихся по направлениям биология, молекулярная биология, генная инженерия, биотехнология, биохимия, биоинформатика и другим смежным направлениям.

Обязательное требование к участникам – владение английским языком на уровне чтения научной литературы.

Отбор будет проходить на основании резюме, мотивационного письма и результатов прохождения отборочного теста.

Целевое число участников программы: 5 человек.

_________________________________________________________________________________________________

По итогам регистрации на программуподано 95 заявок.
По итогам рассмотрения заявок отобрано 5 участников программы.

_________________________________________________________________________________________________

Для участия в конкурсном отборе необходимо пройти регистрацию на сайте Образовательного центра «Сириус» в срок с 8 февраля по 5 марта 2019 года. К электронной заявке прикрепите: резюме, мотивационное письмо и решение тестовых заданий

Результаты отбора будут опубликованы на данном сайте не позднее 18 марта 2019 г.

Партнеры программы

Партнерами Фонда по программе выступают:

Компания ЗАО «Биокад»

Образовательная программа

Название программы: «Ген из пробирки: на стыке математики, биологии и химии»

Направление программы: Наука / Генетика и науки о жизни (Генная инженерия, молекулярная биология)

Формат программы: Профильная, проектная, практика.

Объем программы: 168 часов, из них
         48 часов заочно (теоретическая подготовка); 
        120 часов очно (практическая подготовка, работа над проектом)

Сроки реализации: 22 дня, 9 апреля – 30 апреля 2019 года:
          9 апреля – 14 апреля заочно (теоретическая подготовка); 
          15 апреля – 30 апреля очно (практическая подготовка, работа над проектом)

Цели и задачи программы:

  • выполнение реального кейса компании
  • оптимизация стандартных процедур под конкретную научную задачу в условиях лаборатории
  • составление отчета о выполненной работе, отражение реального состояния проекта с учетом возникших трудностей

Планируемые результаты: В процессе освоения программы планируется, что каждый ее участник:

  • получит глубокое представление о роли вычислительной биологии в персонализированной медицине
  • на практике применит знания, полученные им ранее в ВУЗе и от сотрудников компании, для реализации проекта
  • освоит навыки планирования эксперимента с точки зрения постановки соответствующего контроля и организации рабочего времени

Содержательная характеристика программы: В рамках программы планируется реализация части проекта компании, посвященного кодон-оптимизации/ гуманизации генетической последовательности, кодирующей молекулу-кандидата в одном из проектов компании по получению моноклональных антител как терапевтических агентов в лечении онкологических заболеваний. Сначала участники осуществят in silico оптимизацию и гуманизацию генетических последовательностей, освоят принципы максимально эффективного дизайна олигонуклеотидов для последующего синтеза гена интереса. Затем будет поставлен параллельный синтез олигонуклеотидов с последующей очисткой и характеризацией полученных молекул. После этого из синтезированных олигонуклеотидов каждый участник проекта будет осуществлять параллельно 2-3 сборки различных вариантов гена. Полученные конструкции будут направлены в дальнейшую разработку в R&D-центры компании.
Параллельно практической работе будут проходить семинары в формате Journal club, где будут обсуждаться публикации, подходящие по тематике проекта.

Формы организации образовательного процесса:
          Лекции (дистанционные и очные)
          Биоинформатический воркшоп
          Journal club
          Семинар по проекту / обсуждение текущего состояния
          Работа в лаборатории
          Круглый стол

Дистанционная составляющая программы: Первые 6 дней проекта будут дистанционными. Участникам будет предложено прослушать краткий курс вводных лекций от сотрудников компании, а также самостоятельно изучить предложенные статьи и материалы, которые будут им предоставлены в начале проекта.

Вариативная часть программы: Если участникам будет не хватать знаний в какой-либо области даже после подготовительной теоретической недели, научный руководитель обеспечит необходимые материалы в электронном виде, а также организует лекцию, если будет такая возможность. Пример: Лекция по этике в науке, дизайн эксперимента, построение кросс-функциональных команд.

Требования к условиям организации образовательного процесса: Программа будет полностью осуществляться на базе Лаборатории генно-инженерных технологий.

Этап работы / Необходимые ресурсы:
Дизайн олигонуклеотидов / Учебная аудитория с проектором для демонстрации экрана компьютера преподавателя, компьютеры по числу участников с доступом в интернет
Синтез олигонуклеотидов, Постсинтетическая обработка, 1,2,3 этапы сборки / Лаборатория генно-инженерных технологий
Подготовка к презентации, презентация / Учебная аудитория с проектором, компьютеры по числу участников с доступом в интернет

Оценка реализации программы и образовательные результаты программы:

Содержательный модуль / Оценка в баллах:
Активность на семинарах по проекту / 0 – 10
Выступление на Journal club / 0 – 20
Самостоятельность в работе над проектом / 0 – 40
Участие в подготовке презентации, презентация / 0 – 30
Итого / 100

Кадровое обеспечение: Лекции будут читать сотрудники компании, научное руководство будет осуществляться также сотрудниками компании, экспертную оценку на защите проектов будут осуществлять сотрудники компании, а также приглашенные эксперты. Экспертную поддержку всего проекта будет оказывать Научный директор компании BIOCAD.

Дидактические материалы к программе: Материалы для дистанционного этапа будут предоставлены участникам непосредственно перед началом проекта. Далее материалы будут выдаваться по мере прохождения определенных этапов проекта.

Электронные ресурсы программы:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

http://ugene.net/

http://www.snapgene.com/

http://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/

Авторы и руководитель программы

Руководитель:

Свечников Иван Андреевич, Руководитель лаборатории химического синтеза биополимеров BIOCAD

Авторы:

Кошкарева Кира Александровна, M.S., м.н.с., Лаборатория инженерии и скрининга антител, Лаборатория генно-инженерных технологий, BIOCAD

Яковлев Павел Андреевич, Директор Департамента вычислительной биологии BIOCAD

Надолинский Александр Анатольевич, Заместитель руководителя Департамента вычислительной биологии BIOCAD

Шеуджен Тимур Мугдинович, м.н.с., Лаборатория химического синтеза биополимеров, Лаборатория генно-инженерных технологий BIOCAD

Улитин Андрей Борисович, Директор по науке, Департамент биоинженерии BIOCAD

Материалы программы

Программа

Приложение 1 к программе: Отборочное задание (тест)

Приложение 2 к программе: Учебно-тематический план

Приложение 3 к программе: Пример разбиения проекта на задачи

Хранение материалов программы и система обмена знаниями: Видео с онлайн-лекциями, презентации с лекций, которые были прочитаны очно. Тексты статей, обсуждаемых на JC.

 

Новости:

https://sochisirius.ru/news/2666

Контакты

Центр поддержки выпускников и сопровождения грантовых программ
Фонд «Талант и успех»
8 800 100 86 63
gid@talantiuspeh.ru

Подать заявку Подписаться на рассылку
© 2015–2019 Фонд «Талант и успех»
Нашли ошибку на сайте? Нажмите Ctrl(Cmd) + Enter. Спасибо!